有鳞总目的1目。大多具附肢2对。有的种类1对或2对均退化消失，但体内有肢带的残余。世界已知约3000种。大都分布于热带和亚热带地区，但在欧洲有进入北极圈的。一般体形较小,最长（如科莫多巨蜥）可达4米。一般具外耳孔，鼓膜位于表面或深陷。眼具活动的眼睑和瞬膜（第3眼睑）。舌发达,多扁平而富肌肉。下颌骨左右两半靠骨缝牢固相联，口的张大有限。许多种蜥蜴的每一尾椎都被横隔分成前后两半。肌肉强烈收缩可使尾自该处断掉（“自截”），这是一种保护性或防卫性的机制。断下的尾部有力地猛烈跳动，以迷惑敌害的注意力，蜥蜴却趁机逃走。以后可再生一新尾，但比原尾短小,颜色也较浅,其中仅有软骨棒而无尾椎。蜥蜴类与蛇类内部结构的区别是：蜥蜴体内有前肢带和胸骨，蛇则绝无。蛇类的最后1～2对肋骨分叉，蜥蜴则绝无分叉的肋骨。蛇的肾脏靠体前方，右肾比左肾更靠前，蜥蜴的肾脏则后伸,甚至超过泄殖肛腔的水平,而且两侧对称排列。蜥蜴多以昆虫或其他节肢动物、蠕虫等为食。有些种类兼吃植物，也有专吃植物的。卵生或卵胎生。
现今的分类系统将蜥蜴目分为5个亚目18科。
鬣蜥亚目：分3科，即美洲鬣蜥科、鬣蜥科和避役科
壁虎亚目：分4科，即四肢发达的壁虎科、前肢退化而后肢鳞瓣状的鳞脚蜥科、夜蜥科、有活动眼睑的睑虎科
双足蜥亚目：仅双足蜥科一科
石龙子亚目：分4科，即非洲蜥蜴科、蜥蜴科、石龙子科和美洲蜥蜴科
蛇蜥亚目：分6科，即蛇蜥科、异蜥科、鳄蜥科、巨蜥科、毒蜥科和婆罗蜥科
蜥蜴目Lecertifromes（Sauria）：现代爬行动物种最大的一类，多达4000余种，分布遍及世界各地，形态多样。
1、鬣蜥亚目Iguania：典型的成员背上有鬣鳞，略似楔齿蜥，均四肢完整，不少种类可以变换身体的颜色，并包括一些相貌最独特的蜥蜴，主要分布于热带、亚热带地区，树栖、陆栖或水栖。
美洲鬣蜥科Iguanidae：主要分布于新大陆的鬣蜥，种类繁多，最近常被分成多达8个不同的科。
鬣蜥科Agamidae：旧大陆的鬣蜥，在亚洲和大洋洲最丰富，非洲和欧洲较少，而马达加斯加岛没有分布。
避役科Chamaeleonidae：即变色龙，最独特的蜥蜴，主要分布于非洲特别是马达加斯加岛，少数分布于亚洲和欧洲南部。
2、壁虎亚目Gekkota：包括四肢健全的壁虎和四肢退化的鳞脚蜥等，通常眼睛比较大，眼睑不能活动。全世界现存有116属1110种(2001年统计)。
壁虎科Gekkonidae：蜥蜴中的第二大科，遍及世界各地，包括一些人们最熟悉的爬行动物，也有人将其拆成几个不同的科。
鳞脚蜥科Pygopodidae：分布限于大洋洲，体型似蛇，无前肢，后肢退化成鳞片状。
夜蜥蜴科Xantusiidae：分类地位不定的蜥蜴，略似壁虎，但也有人将其置于石龙子亚目，分布于美洲。
睑虎科Eublepharidae： 有活动眼睑。
3、双足蜥亚目：仅双足蜥科一科
双足蜥科Dibamidae：所知甚少的分类地位不定的蜥蜴，有人将其置于石龙子亚目或自成一独立的亚目，仅雄性有短的后肢，眼退化，多穴居，分布于东南亚。
4、石龙子亚目Scincomorpha：蜥蜴中的最大一类，多有典型的蜥蜴体型，但也有些四肢退化。
非洲蜥蜴科Cordylidae：分布于非洲大陆及马达加斯加岛的小科，有些种类有硬的鳞甲，有人将其分成环尾蜥科和板蜥科两个不同的科。
蜥蜴科Lacertian：旧大陆的陆栖蜥蜴类，以地中海地区为分布中心，也见于欧亚大陆和非洲的其它地区，最北到达北极圈附近。
美洲蜥蜴科Teiidae：新大陆的蜥蜴类，多路栖，少数水栖，有人将其进一步划分为美洲蜥蜴科和裸眼蜥科两个科。
石龙子科Scincidae：蜥蜴中的最大一科，包括蜥蜴中约1/3的种类，四肢健全或退化。分布遍及世界各地，但在亚洲南部和大洋洲种类最多，而欧洲，亚洲北部和美洲种类较少。
5、蛇蜥亚目Anguimorpha：现存种类不多，具有一些与蛇接近的特征，有可能是蛇类的祖先类型，有人将其与石龙子亚目合并，也有人将其进一步划分成两个亚目。蛇蜥亚目包括现存唯一有毒的蜥蜴，现存最大的蜥蜴和生活于海洋中的史前最大的蜥蜴-沧龙。
蛇蜥科Anguidae：包括新大陆的一些有足的蜥蜴和新旧大陆共有的无足蜥蜴，其中有些北美洲的无足蜥蜴有时被单列为蠕蜥科。
异蜥科Xenosauridae：包括北美洲的3种异蜥和我国的鳄蜥，二者也常列为不同的科。
鳄蜥科Shinisauridae：鳄蜥科鳄蜥属仅有的一种——鳄蜥(Shinisaurus crocodilurus)，仅见于中国广西瑶山等地。
毒蜥科Helodermatidae：包括北美洲的两种毒蜥，现存仅有的有毒蜥蜴。
婆罗蜥科Lanthanotidae：又称拟毒蜥科，仅以婆罗州的拟毒蜥为代表。
巨蜥科Varanidae：包括现存体型最大的蜥蜴，但也有些小型种类，主要分布于大洋洲，也见于非洲和亚洲热带地区。
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