大部份的泽龟必须在水里喂食，否则无法吞咽。可以用的食物包括瘦牛肉、鱼、蚯蚓、面包虫跟饲料鱼。很多养龟爱好者喂龟饲料，像 Tetra ReptoMin ，这些都可以从水族店或爬虫店中买到。有些幼龟可能只肯吃活饵，可以用面包虫（可以在水族店买到）或饲料虾。活饵可能会带菌，所以应该把面包虫清洗一下，而且从干净的来源购买。泽龟也常吃青菜叶或水果像香蕉或木瓜。食物应该添加钙粉及维他命。这些东西可以做成乌龟肉块 (turtle meat-loaf) 喂，是用钙粉、维他命加上精瘦的碎牛肉及蔬菜混合做成的。可以事先做好，分装后冷冻起来，要喂之前再解冻。小龟应该每日喂食，成龟每星期喂2至3次。乌龟吃不完的食物都应该拿走。有些饲养者把乌龟移到另一容器喂食，这样可以避免食物污染水质，但有些乌龟在被打扰后可能不吃东西。

    大部分的爬虫类是食肉、食虫或是杂食的，只有少部份是完全草食的爬虫类。经验上，草食的爬虫类不容易人工饲养，因为它们需要比较复杂的营养需求，而人工饲养常常无法完全满足它们。食虫的爬虫类也有它们的问题，由于只喂饲粉虫跟蟋蟀，会造成钙磷比例不对的摄食，而有营养不平衡的情形。另一方面粉虫也含有高量不可消化的几丁质。而喂饲整只哺乳动物的蜥蜴与蛇，就比较不会有营养性的疾病，为保持营养均衡，应在食物中加入爬虫专用的钙粉及维他命。

    人工饲养爬虫类最常见的营养疾病是【代谢性骨营养不良症, metabolic bone disease, MBD】：钙磷摄食不均衡引起二次性的副甲状腺功能亢进，以及骨萎缩。维他命Ｄ3 的缺乏可能是导致此病的原因之一。适当的钙磷比例大约是 1:1 到 2:1。喂食骨胳肌、内脏器官、蔬菜等含钙量低且含磷量高的食物，会导致高磷血症，刺激副甲状腺素分泌，引起骨头中的钙被重吸收到血中，以维持血中的钙磷比，而使得皮质骨变薄并环绕着大量增生的胶质。这种情形在绿鬣蜥相当常见，蜥蜴发生这种情形，通常后肢会丧失运动能力，有可能发生病理性骨折。乌龟除以上症状外，会有软壳的情形。治疗则须改善摄食以校正钙磷比，鬣蜥可喂食泡过的狗粮,鬣蜥饲料与高品质的蔬菜，成年的鬣蜥也可以喂实验用的那种小白鼠。

    鳄鱼发生代谢性骨营养不良症时，鳄鱼会有脊柱会弯曲、下颚发育不正常、牙齿外暴等症状。另外，乌龟还会有壳的发育不良，以及鹦鹉下巴（下巴像鹦鹉的下喙）的情形。

    爬虫类常见许多种维他命缺乏症，如维他命Ａ缺乏症常出现在人工饲养的小泽龟。当喂它的食物以骨胳肌与低品质的蔬菜为主时，会对呼吸与眼球的构造有影响，因为维他命A会使上皮生长并使其结构分化完整。一旦缺乏则会造成这些组织发生病理变化；副泪腺与管腔系统会进行鳞状上皮分化，伴随着结膜炎、眼睑水肿，引起正常分泌物减少的情形。患有维他命A缺乏的乌龟常有食欲不振、眼睑水肿、眼睛闭着张不开、呼吸道可能有纤毛上皮细胞消失的症状。治疗包括改善饮食与投予可维他命Ａ。

    维他命E缺乏也相当常见，主要是喂食含高量不饱和脂肪酸的鱼或是太过肥胖的老鼠所造成。维他命Ｅ主要的功能是抗氧化，而由于不饱和脂肪酸中的 维他命E含量过低，所以易氧化成黑色素 (ceriod)，这种黑色素易引起炎症反应。如果这种黑色素随着脂肪酸被存在脂肪组织中，就会造成脂肪炎。可以给予维他命Ｅ改善状况，并减少喂食含高不饱和脂肪酸的鱼类